A história se ambienta em setembro de , focando-se em Desmond Miles, um assassino que queria ter uma vida normal. Ele se mudou e iniciou uma carreira de bartender fazendo suas compras apenas em dinheiro para não ser detectado nem pelos Assassinos, nem pelos Templários. Porém Desmond acaba querendo comprar uma moto mas para isso ele precisa de uma carteira de motorista, e acaba tendo que colocar sua digital em um documento. E após colocar sua digital nesse documento ele acaba sendo rastreado, sequestrado e levado a um laboratório de uma empresa chamada "Indústrias Abstergo", que conduz pesquisas sobre memória genética. Por meio de sessões com Desmond, o jogador toma conhecimento de que ele é descendente de Altaïr Ibn La-Ahad ("Filho de Nenhum"), um membro da "Ordem dos Assassinos" de e que esteve em uma missão para obter um "Pedaço do Éden", um artefato capaz de criar ilusões, dos Templários. 50 entregar 40 buscar troco 2x1
